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    一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法與流程

    文檔序號:45273579發布日期:2026-04-17 20:17閱讀:13來源:國知局
    技術特征:

    1.一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于,包括以下步驟:

    2.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:獲取肉牛群體的腸道微生物組測序數據及血液轉錄組測序數據,根據腸道微生物組測序數據構建菌群豐度矩陣并計算樣本間的微生態距離,將肉牛群體聚類劃分為不同的營養關聯腸型并提取每一營養關聯腸型的核心指示菌屬的具體過程如下:

    3.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將營養關聯腸型作為分組標簽對血液轉錄組測序數據構建共表達網絡,篩選與特定營養關聯腸型高度關聯的共表達特異性基因的具體過程如下:

    4.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:檢索微生物代謝通路數據庫中核心指示菌屬能夠合成的次級代謝產物,建立包含次級代謝產物化學結構的配體分子數據集的具體過程如下:

    5.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:獲取共表達特異性基因編碼蛋白的三維晶體結構數據,提取蛋白活性結合位點的空間坐標參數的具體過程如下:

    6.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將配體分子數據集中的化學結構映射至蛋白活性結合位點的空間坐標參數范圍內,執行分子構象搜索與吉布斯自由能計算,輸出結合能評分的具體過程如下:

    7.根據權利要求6所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:根據結合能評分對配體分子數據集進行親和力排序,選取結合能評分優于預設閾值的代謝物分子確定為靶向調控共表達特異性基因的靶向效應因子的具體過程如下:

    8.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將靶向效應因子作為檢索探針,在包含天然飼料原料成分及液質聯用數據的特征庫中執行遍歷匹配的具體過程如下:

    9.根據權利要求8所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:選含有靶向效應因子且含量滿足預設濃度的天然原料,生成針對營養關聯腸型的靶向營養源推薦列表的具體過程如下:


    技術總結
    本發明公開了一種基于肉牛腸型?宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,具體涉及生物信息數據處理領域,用于解決現有營養源開發缺乏分子機制驗證及靶向性差的問題。首先,基于微生物組與轉錄組數據劃分營養關聯腸型,構建共表達網絡篩選受特定腸型驅動的宿主共表達特異性基因;隨后,建立菌群代謝物配體集與宿主蛋白受體模型,執行分子構象搜索與吉布斯自由能計算,基于物理親和力篩選高活性的靶向效應因子;最終,利用靶向效應因子對天然原料液質聯用數據進行遍歷匹配與定量篩選,生成針對特定腸型的靶向營養源推薦列表。本發明融合多組學關聯分析與分子熱力學驗證,構建了從微觀機制解析到宏觀原料匹配的精準開發閉環。

    技術研發人員:常晨城,李婉,王偉,趙軍,王崗,龐云,錢佳佳
    受保護的技術使用者:內蒙古元牛繁育科技有限公司
    技術研發日:
    技術公布日:2026/4/16
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