1.一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于,包括以下步驟:
2.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:獲取肉牛群體的腸道微生物組測序數據及血液轉錄組測序數據,根據腸道微生物組測序數據構建菌群豐度矩陣并計算樣本間的微生態距離,將肉牛群體聚類劃分為不同的營養關聯腸型并提取每一營養關聯腸型的核心指示菌屬的具體過程如下:
3.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將營養關聯腸型作為分組標簽對血液轉錄組測序數據構建共表達網絡,篩選與特定營養關聯腸型高度關聯的共表達特異性基因的具體過程如下:
4.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:檢索微生物代謝通路數據庫中核心指示菌屬能夠合成的次級代謝產物,建立包含次級代謝產物化學結構的配體分子數據集的具體過程如下:
5.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:獲取共表達特異性基因編碼蛋白的三維晶體結構數據,提取蛋白活性結合位點的空間坐標參數的具體過程如下:
6.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將配體分子數據集中的化學結構映射至蛋白活性結合位點的空間坐標參數范圍內,執行分子構象搜索與吉布斯自由能計算,輸出結合能評分的具體過程如下:
7.根據權利要求6所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:根據結合能評分對配體分子數據集進行親和力排序,選取結合能評分優于預設閾值的代謝物分子確定為靶向調控共表達特異性基因的靶向效應因子的具體過程如下:
8.根據權利要求1所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:將靶向效應因子作為檢索探針,在包含天然飼料原料成分及液質聯用數據的特征庫中執行遍歷匹配的具體過程如下:
9.根據權利要求8所述的一種基于肉牛腸型-宿主基因互作的靶向營養源挖掘方法,其特征在于:選含有靶向效應因子且含量滿足預設濃度的天然原料,生成針對營養關聯腸型的靶向營養源推薦列表的具體過程如下: